VP35 மற்றும் Ubiquitin (PDB ID 3JKE) இன் சிக்கலானது புரோட்டீன் டாக்கிங் மற்றும் மூலக்கூறு இயக்கவியல் உருவகப்படுத்துதல்களின் கலவையைப் பயன்படுத்தி வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளது. K48 மற்றும் K63 Ub எச்சங்கள் கீழே இடதுபுறத்தில் சயனிலும், Ub க்குள் வலதுபுறத்தில் C-முனையத்திலும் காட்டப்பட்டுள்ளன. வளாகத்தின் ஸ்திரத்தன்மைக்கு பங்களிக்கும் வலுவான தொடர்புகளில் ஒன்று ஏ. ஆர். ஜி 225-ஜி. எல். யூ 18 ஆகும்.